Godzilla ve Kong arasındaki savaşın ardından dünya barışa kavuşmuştur. Ancak, denizlerin derinliklerinden yeni bir canavar ortaya çıkar ve insanlığı tehdit etmeye başlar. Bu canavar karşısında Godzilla ve Kong, geçmişteki husumetlerini bir kenara bırakıp güçlerini birleştirmek zorundadır.